Les femmes et les hommes ayant des problèmes de fertilité peuvent avoirfaible disponibilité en folate, qui est souvent lié au polymorphisme enzymatique MTHFR.
Pour les femmes, le folate est indispensable pendant les périodes de croissance et de prolifération cellulaires rapides, qui surviennent au cours du développement folliculaire et embryonnaire. Un statut insuffisant en folates perturbe la méthylation et l'intégrité de l'ADN, augmente les taux sanguins d'homocystéine et le stress oxydatif peut être lié à la pathogenèse de troubles de la fertilité tels que l'infertilité idiopathique, le syndrome des ovaires polykystiques et l'endométriose.
Pour les hommes, des études soutiennent une relation positive entre les concentrations sériques de folate, la densité et la morphologie régulière des spermatozoïdes.
Le folate est essentieldans la spermatogenèse. En effet, une mauvaise stabilité de l’ADN des spermatozoïdes est corrélée à un faible taux dans le sperme.

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